植物数量性状分离分析Windows软件包SEA的研制

【摘要】剖析植物数量性状遗传体系对作物遗传和育种工作具有重要意义。然而,原植物数量性状分离分析DOS版本计算软件的操作性、算法和功能模块等方面都存在一定缺陷。为此,在MicrosoftVisualStudio2010操作平台下,利用C++语言研制Windows界面友好的植物数量性状分离分析软件包是十分必要的。植物数量性状分离分析软件Windows版本软件包简称SEA是源于分离segregation前两字母和分析analysis首字母。SEA软件包的主要研究内容包括：1)与DOS版本软件相比较,做了如下改进：增加了模型选择功能；利用ClapackV3.1.1求约束条件线性方程组的解和遗传参数的最小二乘估计；调用库BoostV1.51.0计算似然函数、概率和均匀性检验的概率；精确计算了Smirnov检验nW2和Kolmogorov检验Dn的概率；将所有结果合并在一个Excel表格中,变化了输出格式；根据个体或家系数量性状表型值确定其主基因基因型的Bayesian后验概率。通过与SAS计算比较表明：Clapack求线性方程的解和遗传参数的最小二乘估计,Boost计算似然函数、概率分布函数与均匀性检验概率,与SAS相应计算结果无差异。SEA软件包界面更友好,操作更简便,计算更稳定,结果更全面；2)SEA软件包主要有单世代分离分析软件、多世代联合分离分析软件和分离世代个体后验概率分析软件(GClasser)。单世代分离分析软件包括F2单世代分离分析软件(SEA-F2)、F2:3单世代分离分析软件(SEA-F3)、回交衍生家系B1：2和B2：2分离分析软件(SEA-BCF)和回交自交系BIL分离分析软件(SEA-BIL);多世代联合分离分析软件包括P1、P2、F1和F2四世代联合分离分析软件(SEA-G4F2)、P1、P2、F1和F2：3四世代联合分离分析软件(SEA-G4F3)、P1、P2、F1、B1:2和B2：2分离分析软件(SEA-G5BCF)和P1、P2、F1、F2和F2：3五世代联合分离分析(SEA-G5)。3)MonteCarlo模拟研究表明：SEA软件包计算分析的结果具有相对高的准确性。单世代分离分析的精确性没有多世代联合分离分析的精确性高。应当注意,群体成分分布方差、显性效应和主基因遗传率的估计精度虽然可以接受,但是相对要差一些。
【作者】刘兵；
【导师】章元明；
【作者基本信息】南京农业大学，作物遗传育种，2013，硕士
【关键词】数量性状；分离分析；主基因+多基因混合遗传；C++语言；软件包；

【参考文献】
[1]仝艳菲.基于分块匹配的图像被动取证算法研究[D].西南交通大学,信号与信息处理,2014,硕士.
[2]李星.中学美术教育批判性思维探究[D].河北师范大学,学科教学,2012,硕士.
[3]丁捷.基于静压主轴的椭圆异形孔加工方法的基础理论研究[D].山东大学,机械电子工程,2013,硕士.
[4]邱桥成.沙门菌质粒毒力基因spvB突变株的构建及其对上皮细胞自噬的影响[D].苏州大学,免疫学,2012,硕士.
[5]NGUYENVANDINH（阮文定）.PUFA复合材料加固钢筋混凝土圆截面桥墩的试验研究[D].哈尔滨工业大学,桥梁与隧道工程,2013,硕士.
[6]王伟.不确定收益率下证券风险的可拓度量及规避变换[D].大连海事大学,应用数学,2004,硕士.
[7]胡冬缘.2002-2012年第三部门在中国主流媒体报道中的媒介形象变迁研究[D].上海外国语大学,新闻学,2013,硕士.
[8]郑艳.剑文化及其在邵氏武侠电影中的呈现研究[D].山西师范大学,戏剧戏曲学,2014,硕士.
[9]武海鹏.基于IHSDM模型的高速公路安全性评价[D].哈尔滨工业大学,交通运输工程,2013,硕士.
[10]侯修胜.希姆劳特葡萄早期优质丰产栽培[J].西北园艺(果树专刊).2003(02)
[11]尹玮宏.基于串并联忆阻器的混沌振荡器及其应用[D].西南大学,信号与信息处理,2014,硕士.
[12]于健,曲奎.高校图书馆对小微企业读者管理方式探讨[J].农业图书情报学刊,2015,04:190-192.
[13]高超.带状石墨烯边界调控的第一性原理研究[D].华东师范大学,2012.
[14]谢强.质量链管理及其若干关键技术研究[D].南京航空航天大学,2002.
[15]杨世杰.后殖民翻译理论视域下林译《浮生六记》中的翻译杂合策略[D].浙江财经学院,英语语言文学,2013,硕士.
[16]陈龙.基于J2EE的农合行中小企业信用评级系统的设计与实现[D].湖南大学,软件工程,2013,硕士.
[17]鲍远.以Herbert螺钉联合带桡动脉分支蒂骨瓣移植治疗腕舟骨骨折不愈合[D].华中科技大学,外科学,2013,硕士.
[18]赵磊.石墨烯基质子交换膜燃料电池阳极催化剂的研究[D].哈尔滨工业大学,化学工程与技术,2014,硕士.
[19]贾储源.二氧化碳驱表面活性剂的设计与合成[D].吉林大学,高分子化学与物理,2014,硕士.
[20]杨柳.新型两性表面活性剂的分子有序组合体研究[D].东北石油大学,应用化学,2013,硕士.
[21]荀洁.女性“自己的一间屋”？[D].苏州大学,2004.
[22]邓春闽.表面活性剂对再生丝素蛋白凝胶化的影响及作为药物缓释载体的研究[D].苏州大学,纺织材料与纺织品设计,2013,硕士.
[23]郭立.IGBT动态特性测试的搭建及其在电磁炉应用中的研究[D].复旦大学,集成电路工程,2012,硕士.
[24]姜耘.中美休闲体育的比较研究[D].苏州大学,运动人体科学,2003,硕士.
[25]程伟.少齿数齿轮传动强度分析与参数设计[D].陕西理工学院,机械设计及理论,2013,硕士.
[26]计伟荣,曾玉龙,谭冶斌,应惠娟,张莹.载体酸碱性对镍基催化剂催化甘油水蒸汽重整制氢影响[J].浙江工业大学学报,2013,01:6-9.
[27]杨波.我国领导干部“引咎辞职”制度研究[D].吉林大学,行政管理,2004,硕士.
[28]张之伟.零售企业配送中心的易逝品库存控制与门店配送研究[D].北京交通大学,2013.
[29]魏旭鹏.基于随机场理论的单裂隙非饱和渗透系数研究[D].哈尔滨工业大学,岩土工程,2013,硕士.
[30]许昳宁.道德伦理之冲突与化解[D].复旦大学,外国哲学,2012,硕士.
[31]郑立炎.电致化学发光新材料的研究[D].福州大学,2011.
[32]胡潜.关于网络信息资源组织与开发技术推进策略的思考[J].情报科学,2005,07:1040-1044.
[33]潘康宇.我国人力资源价值计量方法研究[D].长春理工大学,企业管理,2004,硕士.
[34]聂利娟.武汉城市圈的资本配置效率及影响因素研究[D].华中科技大学,会计学,2012,硕士.
[35]李东海,姜学智,徐忠净,李立勤,谢茂清.一类不可逆系统的非线性控制及预期动力学方程的选取[J].控制与决策,1998,06:71-74.
[36]许姣妮.中国女性社会地位的伦理探析[D].西南大学,伦理学,2013,硕士.
[37]何振龙.论柏格森哲学对时间的阐释[D].吉林大学,外国哲学,2013,硕士.
[38]齐妙青.乌鲁木齐市碳排放测算与减排途径研究[D].新疆师范大学,人口、资源与环境经济学,2013,硕士.
[39]甘旭升,端木京顺,丛伟.SSUKF-WNN算法及其在飞行器气动力建模中的应用[J].控制与决策,2011,02:187-190+195.
[40]夏园园张风帆计彤.马克思主义人学视角下的“中国梦”解读[J].云南社会主义学院学报.
[41]宋瑛.东乡野生稻休眠芽的遗传生理研究[D].江西农业大学,作物遗传育种,2011,硕士.
[42]俞秀冲.微小RNA-129影响胃癌细胞生长的机制研究[D].宁波大学,生物化学与分子生物学,2013,硕士.
[43]黄新武,吴律,田子奇.约束加权克希霍夫法VSP资料反射成像[J].石油地球物理勘探,1998,02:222-229+284.
[44]顾卿.面向装备数据中ETL工具的设计及实现[D].复旦大学,计算机技术,2012,硕士.
[45]唐功友,张勇.一类不确定性非线性网络控制系统的扰动抑制[J].控制与决策,2008,09:1055-1059+1064.
[46]李明明.英文租船合同词汇的量化分析[D].大连海事大学,外国语言学及应用语言学,2014,硕士.
[47]史媛媛.南阳市旅游开发的生态环境影响研究[D].华中师范大学,农村与区域发展（专业学位）,2013,硕士.
[48]许斌.股骨颈骨折不愈合高危因素的相关性研究[D].河北医科大学,外科学,2013,硕士.
[49]畅瑞苗.五味子活性成分的筛选及其对心肌缺血/再灌注的保护作用[D].山西医科大学,药物分析学,2013,硕士.
[50]钟平平.城市青年廉租公寓居住空间研究[D].湖南大学,建筑学,2012,硕士.